رفتن به محتوای اصلی
توضیح کوهستانمنشأ حیاتبسته شواهد۲۰ تیر ۱۴۰۵، ۲۲:۲۲· 6 دقیقه مطالعه· در علم

کشف مولکول RNA خودتکثیرشونده، قوی‌ترین مدرک برای نظریه منشأ حیات

دانشمندان یک مولکول RNA را مهندسی کرده‌اند که قادر به خودتکثیری پایدار و با دقت بالا است و از یک آستانه مهم در اثبات چگونگی گذار شیمی به زیست‌شناسی در زمین اولیه عبور کرده است.

به قلم فرشید جمشیدی

حامیان دنیای RNA 55%شکاکان شیمی پیش‌زیستی 25%جامعه اخترزیست‌شناسی 20%
حامیان دنیای RNA
استدلال می‌کنند که این کشف به طور مؤثری مانع مکانیکی اصلی منشأ حیات را حل می‌کند و ثابت می‌کند که RNA به تنهایی می‌تواند تکامل داروین را آغاز کند.
شکاکان شیمی پیش‌زیستی
معتقدند که در حالی که مکانیک تکثیر اثبات شده است، شرایط آزمایشگاهی بسیار خالص، واقعیت شیمیایی آشفته زمین اولیه را به درستی منعکس نمی‌کند.
جامعه اخترزیست‌شناسی
بر پیامدهای فرازمینی تمرکز دارند و سادگی چرخه تکثیر RNA را به عنوان یک تقویت بزرگ برای احتمال وجود حیات در قمرهای اقیانوسی مانند انسلادوس می‌بینند.
۹۹.۸%
نرخ دقت تکثیر
۱۵۰
نوکلئوتیدها در مولکول RNA جدید
۴.۲ میلیارد
تخمین سال‌های پیش که حیات RNA آغاز شد
۳.۸ میلیارد
سال‌های پیش که اولین ریزسنگواره‌ها ظاهر شدند

برای بیش از نیم قرن، زیست‌شناسان با معمای مرغ و تخم‌مرغ در سپیده‌دم حیات درگیر بوده‌اند. زیست‌شناسی مدرن برای ذخیره نقشه‌های ژنتیکی به DNA و برای اجرای آن‌ها به پروتئین‌ها متکی است، اما هیچ‌کدام بدون دیگری نمی‌توانند وجود داشته باشند. DNA برای کپی‌برداری از خود به پروتئین نیاز دارد و پروتئین‌ها برای دستورالعمل‌های خود به DNA. راه‌حل غالب برای این پارادوکس، که در دهه ۱۹۶۰ پیشنهاد شد، فرضیه «دنیای RNA» است: این ایده که حیات اولیه کاملاً به RNA متکی بوده است، مولکولی همه‌کاره که قادر است هم اطلاعات را مانند DNA ذخیره کند و هم واکنش‌های شیمیایی را مانند یک پروتئین آغاز نماید.[1][5]

در حالی که فرضیه دنیای RNA ظریف و زیبا است، همیشه فاقد یک مدرک فیزیکی حیاتی بوده است. برای اینکه این نظریه کار کند، باید یک مولکول RNA اولیه وجود داشته باشد که بتواند به عنوان یک «تکثیرکننده» (replicase) عمل کند – آنزیمی که می‌تواند یک رشته RNA دیگر را بخواند و یک کپی دقیق از آن بسازد. بدون این مکانیسم خودتکثیری، تکامل داروین هرگز نمی‌توانست آغاز شود.[1][5]

اکنون، مقاله‌ای مهم که در نشریه «نیچر» (Nature) منتشر شده، آن حلقه مفقوده را فراهم کرده است. محققان با موفقیت یک مولکول RNA به طول تنها ۱۵۰ نوکلئوتید را مهندسی کرده‌اند که می‌تواند به طور مستقل و دقیق از سایر مولکول‌های RNA، از جمله گونه‌های خود، کپی بگیرد. این کشف از یک آستانه عظیم عبور می‌کند و برای اولین بار نشان می‌دهد که مکانیک بنیادی حیات می‌تواند صرفاً از شیمی پدید آید.[1]

فرضیه جهان RNA اینگونه فرض می‌کند که حیات اولیه برای ذخیره‌سازی داده و کاتالیز واکنش‌ها، به یک مولکول واحد متکی بود.

مانع اصلی در ایجاد یک RNA خودتکثیرشونده از لحاظ تاریخی، «فاجعه خطا» (error catastrophe) بوده است. هنگامی که مولکول‌ها از خود کپی می‌گیرند، اشتباهاتی مرتکب می‌شوند. اگر یک مولکول RNA در طول تکثیر خطاهای زیادی داشته باشد، اطلاعات ژنتیکی به سرعت تخریب می‌شود و مولکول‌های «فرزند» شکل عملکردی خود را از دست می‌دهند. تلاش‌های قبلی برای ایجاد تکثیرکننده‌های RNA در آزمایشگاه منجر به مولکول‌هایی شد که در عرض چند نسل جهش یافته و بی‌فایده می‌شدند.[5]

ریبوزیم تازه کشف‌شده بر این پرتگاه ریاضی غلبه می‌کند. این مولکول با استفاده از یک چین‌خوردگی ساختاری جدید که رشته الگو را محکم‌تر نگه می‌دارد، به نرخ دقت تکثیر ۹۹.۸٪ دست می‌یابد. این بدان معناست که به ازای هر هزار نوکلئوتیدی که کپی می‌کند، کمتر از دو اشتباه دارد. به گفته زیست‌شناسان تکاملی، این آستانه ۹۹.۸٪ دقیقاً نقطه عطف ریاضی مورد نیاز برای پیشی گرفتن از فاجعه خطا است، که به اطلاعات ژنتیکی پیچیده اجازه می‌دهد در طول زمان زنده بمانند و تکامل یابند.

ریبوزیم جدید به نرخ دقت ۹۹٫۸٪ دست می‌یابد و با موفقیت از آستانه مورد نیاز برای بقا در برابر «فاجعه خطا» عبور می‌کند.

دستیابی به دقت بالا تنها نیمی از نبرد بود. تیم تحقیقاتی همچنین باید «مشکل جداسازی رشته» را حل می‌کرد. هنگامی که یک مولکول RNA از یک الگو کپی می‌گیرد، رشته جدید به طور طبیعی محکم به رشته قدیمی متصل می‌شود و یک مارپیچ دوتایی سفت و سخت ایجاد می‌کند که نمی‌تواند دوباره کپی شود. در سلول‌های مدرن، موتورهای پروتئینی پیچیده به طور فیزیکی این رشته‌ها را از هم جدا می‌کنند.[5]

برای دور زدن نیاز به پروتئین‌ها، محققان مولکول‌های RNA خود را تحت چرخه‌سازی حرارتی قرار دادند – تغییرات سریع بین محیط‌های گرم و سرد. این فرآیند شرایط طبیعی موجود در منافذ گرمابی اعماق دریا را تقلید می‌کند، جایی که آب معدنی فوق‌العاده گرم با جریان‌های اقیانوسی نزدیک به انجماد برخورد می‌کند. گرما به طور طبیعی رشته‌های RNA را از هم ذوب می‌کند، در حالی که سرما به بلوک‌های ساختمانی جدید اجازه اتصال می‌دهد و یک موتور تکثیر پیوسته و مستقل ایجاد می‌کند.[2]

چرخه‌سازی حرارتی در اطراف منافذ گرمابی اعماق دریا ممکن است تغییرات دمایی طبیعی مورد نیاز برای تکثیر RNA اولیه را فراهم کرده باشد.
برای دور زدن نیاز به پروتئین‌ها، محققان مولکول‌های RNA خود را تحت چرخه‌سازی حرارتی قرار دادند – تغییرات سریع بین محیط‌های گرم و سرد.

عمیق‌ترین لحظه آزمایش زمانی رخ داد که محققان تکثیرکننده RNA را برای چندین هفته در محلولی غنی از مواد مغذی رها کردند. مولکول فقط از خود کپی نگرفت؛ بلکه شروع به تکامل کرد. جهش‌های تصادفی و نادری که سرعت کپی‌برداری مولکول را بهبود می‌بخشیدند، به طور طبیعی انتخاب شدند و در نهایت بر لوله آزمایش غالب گشتند. دانشمندان شاهد وقوع تکامل داروین در زمان واقعی بودند، کاملاً عاری از سلول، DNA یا پروتئین.[1][5]

این نمایش تکامل مولکولی، قوی‌ترین پشتوانه تجربی را برای جدول زمانی زمین اولیه فراهم می‌کند. زمین‌شناسان تخمین می‌زنند که اولین تکثیرکننده‌های RNA احتمالاً حدود ۴.۲ میلیارد سال پیش، اندکی پس از شکل‌گیری اقیانوس‌های سیاره، پدید آمده‌اند. این مولکول‌های ساده صدها میلیون سال فرصت داشتند تا به اشکال حیات سلولی پیچیده‌تری تبدیل شوند که اولین ریزسنگواره‌ها را ۳.۸ میلیارد سال پیش بر جای گذاشتند.[1][5]

با وجود این پیشرفت، بسته شواهد بدون شک و تردید نیست. منتقدان در جامعه شیمی پیش‌زیستی به یک آسیب‌پذیری طولانی‌مدت در مدل دنیای RNA اشاره می‌کنند: در دسترس بودن مواد خام. آزمایش «نیچر» متکی بر تأمین مداوم نوکلئوتیدهای فعال‌شده و بسیار خالص بود که توسط محققان فراهم شد.[4][5]

شکاکان استدلال می‌کنند که اقیانوس‌های اولیه یک «سوپ پیش‌زیستی» آشفته بودند که مملو از آلاینده‌های شیمیایی بود و در مونتاژ RNA اختلال ایجاد می‌کرد. آن‌ها پیشنهاد می‌کنند که در حالی که این ریبوزیم جدید ثابت می‌کند RNA می‌تواند در یک آزمایشگاه استریل تکثیر شود، اما به طور قطعی ثابت نمی‌کند که چنین فرآیند ظریفی می‌تواند در محیط شیمیایی آشفته و قیرمانند زمین اولیه بدون یک چرخه متابولیکی ساده‌تر و پیشین که راه را هموار کند، زنده بماند.[4][5]

با این حال، طرفداران در پاسخ می‌گویند که ریزمحیط‌های خاص – مانند سنگ متخلخل داخل منافذ گرمابی یا کانال‌های میکروسکوپی آب در یخ دریا – می‌توانستند به طور طبیعی نوکلئوتیدهای لازم را فیلتر و متمرکز کنند و گهواره‌ای محافظت‌شده برای استقرار اولین تکثیرکننده‌ها فراهم آورند.[1]

فراتر از زمین، این کشف موج‌هایی را در جامعه اخترزیست‌شناسی ایجاد کرده است. اگر گذار از شیمی غیرزنده به زیست‌شناسی خودتکثیرشونده تنها به RNA، چرخه‌سازی حرارتی و نوکلئوتیدهای پایه نیاز داشته باشد، دستورالعمل حیات بسیار ساده‌تر از آن چیزی است که قبلاً تصور می‌شد. این سادگی به طور چشمگیری شانس جرقه زدن حیات در گوشه‌های دیگر منظومه شمسی را افزایش می‌دهد.[2][3]

تغییرات سریع بین آب گرم و سرد به رشته‌های RNA اجازه می‌دهد تا جدا شده و چرخه تکثیر را ادامه دهند.

اخترزیست‌شناسان به ویژه بر قمرهای یخی مشتری و زحل، مانند اروپا و انسلادوس، تمرکز کرده‌اند. هر دو قمر دارای اقیانوس‌های زیرسطحی عظیمی از آب مایع هستند و فضاپیمای کاسینی پیش‌تر مولکول‌های آلی و شواهدی از منافذ گرمابی را در انسلادوس شناسایی کرده است. کشف جدید RNA نشان می‌دهد که این منافذ فرازمینی دارای شرایط حرارتی و شیمیایی دقیقی هستند که برای هدایت چرخه‌های جداسازی رشته و تکثیر مشاهده‌شده در آزمایشگاه لازم است.[2][3][5]

پیامدهای این کشف به جستجوی حیات باستانی در مریخ نیز گسترش می‌یابد. میلیاردها سال پیش، مریخ دارای آتشفشان‌های فعال و آب سطحی بود که سیستم‌های گرمابی مشابه زمین اولیه ایجاد می‌کرد. اگر حیات مبتنی بر RNA یک پیامد ترمودینامیکی طبیعی این محیط‌ها باشد، بقایای فسیل‌شده چنین اکوسیستم‌های مولکولی ممکن است هنوز در سنگ‌های مریخ حفظ شده باشند.[2][3]

فاز بعدی تحقیقات تلاش خواهد کرد تا تکثیرکننده RNA را حتی فراتر ببرد. دانشمندان اکنون در تلاشند تا ببینند آیا می‌توان مولکول را وادار کرد که نه تنها از خودش، بلکه از سایر رشته‌های RNA عملکردی که وظایف متابولیکی اساسی مانند تجزیه قندهای ساده برای انرژی را انجام می‌دهند، کپی بگیرد. در صورت موفقیت، آن‌ها عملاً یک پیش‌سلول مصنوعی ایجاد کرده‌اند.[1]

در حالی که ممکن است هرگز توالی تاریخی دقیق رویدادهایی که ۴ میلیارد سال پیش به سیاره ما جان بخشیدند را ندانیم، «جادوی» منشأ حیات به طور پیوسته با مکانیک قابل اندازه‌گیری و قابل بازتولید جایگزین می‌شود. کشف یک مولکول RNA خودتکثیرشونده ثابت می‌کند که جهش از شیمی به زیست‌شناسی یک معجزه غیرممکن نیست، بلکه یک پیامد طبیعی و اجتناب‌ناپذیر قوانین فیزیکی جهان است.[1][5]

آنچه نمی‌دانیم

  • اینکه آیا نوکلئوتیدهای بسیار خالص مورد نیاز برای این چرخه تکثیر به طور طبیعی در زمین اولیه فراوان بوده‌اند یا خیر.
  • اینکه چگونه این تکثیرکننده‌های اولیه RNA در نهایت به سیستم‌های پایدارتر و پیچیده‌تر DNA و پروتئین که توسط تمام حیات مدرن استفاده می‌شوند، تبدیل شدند.
  • اینکه آیا این مکانیسم خاص RNA یک مسیر جهانی برای حیات در کیهان است، یا فقط یکی از مسیرهای شیمیایی ممکن متعدد.

منابع

پوشش منابع

5 منبع

3 دیدگاه شناسایی‌شده

حامیان دنیای RNA 55%شکاکان شیمی پیش‌زیستی 25%جامعه اخترزیست‌شناسی 20%
  1. [1]Scienceحامیان دنیای RNA

    The 'RNA World' hypothesis finally gets its missing link

    مطالعه در Science
  2. [2]New Scientistجامعه اخترزیست‌شناسی

    Self-copying RNA breakthrough boosts hopes for finding alien life

    مطالعه در New Scientist
  3. [3]Astrobiology Journalجامعه اخترزیست‌شناسی

    Implications of Autonomous RNA Replication for Enceladus and Europa Habitability Models

    مطالعه در Astrobiology Journal
  4. [4]Journal of Molecular Evolutionشکاکان شیمی پیش‌زیستی

    Prebiotic Nucleotide Availability Remains a Constraint on the RNA World Model

    مطالعه در Journal of Molecular Evolution
  5. [5]تیم سردبیری کوهستان

    تحلیل تیم سردبیری کوهستان

    مطالعه در تیم سردبیری کوهستان

نظرات

همیشه در جریان باشید

هر زاویه. هر روز.

دریافت علم اخبار همراه با پوشش کامل منابع و تحلیل دیدگاه‌ها، مستقیم در صندوق ورودی شما.